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胎牛血清RNA干擾了細(xì)胞培養(yǎng)外源性RNA

2016-10-08 15:11

注：在用胎牛血清培養(yǎng)細(xì)胞時(shí)，有沒有重視與對細(xì)胞培養(yǎng)FBS的RNA內(nèi)容相關(guān)的生物學(xué)效應(yīng)呢？想知道答案嗎？請繼續(xù)閱讀。

胎牛血清（FBS），已在真核細(xì)胞培養(yǎng)物被使用了幾十年。然而，很少受到人們的重視與對細(xì)胞培養(yǎng)FBS的RNA內(nèi)容相關(guān)的生物學(xué)效應(yīng)。在這里，用RNA測序，我們證明了FBS含有蛋白質(zhì)編碼和調(diào)控RNA物種，包括基因，miRNA的，rRNA基因和的snoRNA的不同劇目。他們中的大多數(shù)（>70％），甚至在囊泡耗盡FBS（vdFBS）在細(xì)胞外囊泡（EV）和細(xì)胞間通訊的研究通常使用的準(zhǔn)備擴(kuò)展超速離心后保留。FBS的相關(guān)聯(lián)的RNA是共分離細(xì)胞培養(yǎng)物的細(xì)胞RNA（exRNA）和與下游RNA分析干擾。許多進(jìn)化上保守的FBS衍生的RNA種類可以被錯(cuò)誤地標(biāo)注為人類或小鼠成績單。

值得注意的是，在FBS的豐富特定的miRNA，如的miR-122中，miR-451A和miR-1246，先前已為富集在細(xì)胞培養(yǎng)衍生的電動(dòng)汽車，可能是由于胎牛血清的混雜影響的報(bào)道。公開可用的數(shù)據(jù)集exRNA分析支持FBS污染的概念。此外，F(xiàn)BS轉(zhuǎn)錄可通過培養(yǎng)的細(xì)胞吸收，并影響高度敏感的基因表達(dá)譜技術(shù)的結(jié)果。因此，對于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的預(yù)防措施是必要的，以減少因FBS衍生的RNA干擾和曲解。



通過培養(yǎng)細(xì)胞胞外囊泡（電動(dòng)汽車）和脂蛋白復(fù)合物（的RNP）的形式發(fā)布外RNA（exRNA）的深度序列分析是研究一個(gè)擴(kuò)展的領(lǐng)域。


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