環(huán)狀RNA有望作為癌癥生物標(biāo)志物

隨著新技術(shù)允許科學(xué)家們深入研究基因組和外顯子組，一類(lèi)新的稱(chēng)為環(huán)狀RNA（circular RNA, circRNA）的RNA可能發(fā)揮著一種有趣的作用。

在一項(xiàng)新的研究中，來(lái)自美國(guó)密歇根大學(xué)的研究人員對(duì)多種癌癥中的circRNA進(jìn)行了編目，并進(jìn)行了初步研究，表明這些穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)可能作為血液或尿液中的癌癥生物標(biāo)志物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年2月7日的Cell期刊上，論文標(biāo)題為“The Landscape of Circular RNA in Cancer”。

circRNA是一種非編碼RNA，它們形成閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu)而不是線性結(jié)構(gòu)。新的RNA測(cè)序方法曝光了這些circRNA，但是人們對(duì)它們起作用的原因或方式知之甚少。不過(guò)它們的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)使得它們成為癌癥生物標(biāo)志物的理想候選對(duì)象。

這項(xiàng)新的研究確定了癌癥中的circRNA目錄，從而為未來(lái)的研究構(gòu)建了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。論文共同通訊作者、密歇根大學(xué)轉(zhuǎn)化病理學(xué)中心主任Arul M. Chinnaiyan博士說(shuō)，“我對(duì)circRNA作為非侵入性生物標(biāo)志物的潛力感到非常興奮。鑒于它們的穩(wěn)定性，我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測(cè)到它們。這可能對(duì)癌癥的診斷或預(yù)后有用。”

作為MiONCOSEQ項(xiàng)目的一部分，這些研究人員從800多個(gè)腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了circRNA。他們證實(shí)為MiONCOSEQ項(xiàng)目開(kāi)發(fā)的捕獲RNA測(cè)序在檢測(cè)circRNA方面比現(xiàn)有方法更為強(qiáng)大。

Chinnaiyan說(shuō)，“這種捕獲方法可能是有限的，這是因?yàn)樗谖覀冇脕?lái)捕獲RNA的探針。但是，全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過(guò)這種方式捕獲大量的RNA。這就是為何我們能夠鑒定出如此多的之前并不知道的circRNA。”

這種技術(shù)僅需少量總RNA就能夠鑒定出circRNA。這意味著它們可能在RNA被稀釋的地方被檢測(cè)到，比如血液或尿液。

此外，這些研究人員還鑒定出幾種在前列腺癌組織中發(fā)現(xiàn)的circRNA。通過(guò)評(píng)估來(lái)自前列腺癌細(xì)胞的circRNA，他們發(fā)現(xiàn)它們比線性RNA更穩(wěn)定。它們也可在尿液樣品中檢測(cè)到。

Chinnaiyan說(shuō)，“我們能夠證實(shí)這些circRNA存在于尿液中并且來(lái)自前列腺癌的circRNA可被檢測(cè)到。我們未來(lái)的研究將探究這些circRNA作為尿液或血液中的癌癥生物標(biāo)志物。”

這些研究人員將他們的研究結(jié)果轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€(gè)名為MiOncoCirc的數(shù)據(jù)庫(kù)，這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)腫瘤樣本中報(bào)道的circRNA進(jìn)行編目。這種資源可供科學(xué)家們使用，有助于開(kāi)發(fā)新的癌癥生物標(biāo)志物。