一種新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化

在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所和哈佛大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)有證據(jù)表明使用堿基編輯器會導(dǎo)致細胞中出現(xiàn)意想不到的RNA編輯。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標(biāo)題為“Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors”。在這篇論文中，他們描述了他們對CRISPR類型腺嘌呤堿基編輯器（ABE）的研究，以及他們?nèi)〉玫陌l(fā)現(xiàn)。

ABE將一個DNA堿基對轉(zhuǎn)換成另一個DNA堿基對，從而允許修復(fù)某些細胞類型中的突變，而不會產(chǎn)生不想要的編輯效應(yīng)。據(jù)認為，ABE還有潛力校正幾乎一半已知的導(dǎo)致醫(yī)學(xué)疾病的遺傳異常。ABE的科學(xué)基礎(chǔ)對醫(yī)學(xué)界來說變得越來越重要。不幸的是，最近的一些研究已發(fā)現(xiàn)，ABE可能也會導(dǎo)致意料之外的編輯。在今年3月，一個研究團隊發(fā)現(xiàn)胞嘧啶堿基編輯器3型（CBE3）以高于正常的速率誘導(dǎo)單核苷酸變異。在上個月，另一個研究團隊發(fā)現(xiàn)胞嘧啶堿基編輯器（CBE）和ABE導(dǎo)致RNA中的脫靶編輯。在這項新的研究中，這些研究人員試圖在使用ABE時進一步測試脫靶編輯，并在確認后找到一種解決方案。

這些研究人員以一種包括人細胞系中所有細胞RNA轉(zhuǎn)錄本的方式分析了ABE的最新版本，稱為ABEmax，而且他們使用比其他人使用的更靈敏的工具來做到這一點。他們報道他們確實在RNA樣本中發(fā)現(xiàn)了低水平的脫靶編輯。為了解決這個問題，他們開發(fā)了在保留在靶堿基編輯的能力同時導(dǎo)致較少RNA編輯的新型ABE變體（基于滅活的野生型大腸桿菌）。他們進一步報道說，這些新型變體是以一種讓RNA和DNA編輯過程解耦合的方式構(gòu)建出來的，這樣就能夠**限度地減少DNA和RNA中的脫靶編輯。

這些研究人員得出結(jié)論：由于較低的RNA編輯且較短的RNA半衰期，對未來研究的干擾程度可能取決于它們的具體應(yīng)用。他們建議尋求讓RNA編輯最小化的科學(xué)家們使用他們構(gòu)建出的一種新變體---他們稱之為ABEmaxQW。