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科學(xué)家開發(fā)出能有效區(qū)分細胞中新舊基因轉(zhuǎn)錄物的新方法

2020-03-10 08:52來源:生物谷


一項刊登在國際雜志Science上的研究報告中,來自胡布勒支研究所等機構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種新方法,來評估基因轉(zhuǎn)錄物的產(chǎn)生和降解是如何被調(diào)節(jié)的,研究者發(fā)現(xiàn),細胞能利用不同的策略來控制轉(zhuǎn)錄物拷貝的數(shù)量,其是細胞正常發(fā)揮功能不可或缺的。

    

我們的機體由數(shù)萬億個含有相同DNA的細胞組成,盡管每個細胞中的DNA都是相同的,但有機體卻是由不同的細胞類型所組成,每一種類型的細胞都有著不同的功能,在不同的細胞類型中,DNA上不同類型的基因就會處于活性狀態(tài),而不同的“配方”會被用來構(gòu)建細胞的組分,這就能幫助確定細胞的類別,比如皮膚細胞或肌肉細胞等,為了完成這項任務(wù),細胞就必須復(fù)制基因,即所謂的轉(zhuǎn)錄物,其會被用來制造蛋白。


細胞中每個基因轉(zhuǎn)錄物的數(shù)量能夠幫助測定基因的活性,這個數(shù)量會被制造的基因拷貝所影響,即轉(zhuǎn)錄的過程,破壞當前已經(jīng)存在的基因拷貝(即降解)也會影響轉(zhuǎn)錄物的數(shù)量;在單一細胞中,通過破碎細胞就能測定轉(zhuǎn)錄物拷貝的數(shù)量,因此不能在同一細胞中隨著時間的推移進行追蹤。截至目前為止,研究人員并不清楚單一細胞中轉(zhuǎn)錄物的組合和降解是如何調(diào)節(jié)特殊轉(zhuǎn)錄物拷貝的數(shù)量的。


這項研究中,研究就開發(fā)了一種新型單細胞測序技術(shù),其能有效將新制造的轉(zhuǎn)錄物和此前已經(jīng)存在的轉(zhuǎn)錄物進行有效區(qū)分;通過將相關(guān)數(shù)據(jù)與計算機模型相結(jié)合,研究人員就發(fā)現(xiàn),基因的轉(zhuǎn)錄和降解主要參與到了調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄物的數(shù)量中去,研究者Battich說道,細胞似乎能夠利用不同的策略來調(diào)節(jié)基因的活性或其轉(zhuǎn)錄物拷貝的數(shù)量;對于某些基因而言,細胞不得不快速改變其拷貝數(shù),而這些基因生來就會在高水平下被轉(zhuǎn)錄并降解,通過參與這些過程,細胞就會通過降低轉(zhuǎn)錄并同時增加降解來快速改變拷貝數(shù)。


最后研究者表示,這種名為scEU-seq的技術(shù)能被用來研究生物體多個過程,比如發(fā)育期間細胞的特殊化,健康和癌癥系統(tǒng)中細胞分類的調(diào)節(jié)機制等。