科學家鑒別出應(yīng)對新型冠狀病毒感染的免疫反應(yīng)的潛在靶點！

兩個月內(nèi)，一種此前并不為人所熟知的新型冠狀病毒SARS-CoV-2在全球開始傳播，感染了超過10萬人（新聞發(fā)布時的數(shù)據(jù)），而且目前感染人數(shù)還在持續(xù)上升，有效的應(yīng)對措施需要有用的工具來幫助監(jiān)測病毒的傳播，同時研究人員還需要了解機體免疫系統(tǒng)如何對病毒產(chǎn)生反應(yīng)。

近日，一項刊登在國際雜志Cell Host & Microbe上的研究報告中，來自美國La Jolla免疫研究所等機構(gòu)的科學家們就通過研究**分析了針對新型冠狀病毒的機體有效免疫反應(yīng)的潛在靶點，如今研究人員能利用已知的冠狀病毒的數(shù)據(jù)來預(yù)測SARS-CoV-2的哪些部位能夠激活宿主的免疫系統(tǒng)反應(yīng)。

當宿主免疫系統(tǒng)遭遇細菌或病毒感染時，其會瞄準微小的分子特征，即所謂的抗原表位（epitopes），抗原表位能促進宿主免疫系統(tǒng)的細胞有效區(qū)分外來侵入者并對其進行集中攻擊，而獲得完整的病毒表位圖譜及其免疫原性對于研究人員開發(fā)新型疫苗或改善當前疫苗來幫助有效抵御COVID-19至關(guān)重要。

研究者Biol.Sci表示，目前，關(guān)于病毒的哪些片段會引起宿主機體強烈的免疫反應(yīng)，我們所掌握的信息非常有限，了解某些病毒區(qū)域的免疫原性，換句話說，也就是免疫系統(tǒng)會對病毒的哪些部分產(chǎn)生反應(yīng)，對于開發(fā)新型新型候選疫苗并評估其療效至關(guān)重要；如今科學家們并不清楚人類免疫系統(tǒng)如何對SARS-CoV-2產(chǎn)生反應(yīng)，而研究人員已經(jīng)研究了免疫系統(tǒng)對其它冠狀病毒的反應(yīng)，并獲得了大量的抗原表位數(shù)據(jù)。

目前其它四種冠狀病毒也正在人群中傳播，其通常會引發(fā)輕微的癥狀，據(jù)估計，其在所有季節(jié)性流感中也僅占到了四分之一的比例；每隔幾年就會出現(xiàn)一種新型的冠狀病毒，并引發(fā)嚴重的疾病，就想好2003年的SARS-CoV和2008年的MERS-CoV以及2019年的SARS-CoV-2。研究者Alba Grifoni博士說道，SARS-CoV-2與SARS-CoV的親緣關(guān)系最為密切；這項研究中，我們對基于來自研究所免疫表位數(shù)據(jù)庫（IEDB）的可用數(shù)據(jù)進行分析，繪制了SARS-CoV已知的抗原表位并將相應(yīng)的區(qū)域映射到了SARS-CoV-2上。IEDB含有來自3600種不同物種和病毒病原體資源庫中的60萬個已知的表位。

研究者表示，他們能將10個B細胞表位映射到新型冠狀病毒上，由于SARS-CoV-2與SARS-CoV具有高度的序列相似性，因此在SARS-CoV中具有免疫優(yōu)勢的相同區(qū)域也很有可能在SARS-CoV-2中也有優(yōu)勢。這些區(qū)域中有5個區(qū)域是在刺突糖蛋白中發(fā)現(xiàn)的，刺突糖蛋白能形成病毒的“冠狀”結(jié)構(gòu)，其中2個區(qū)域存在于膜蛋白中，膜蛋白能嵌入到包裹病毒基因組的保護性蛋白外殼的膜中，另外3個區(qū)域位于構(gòu)成外殼的核蛋白中。

在相同的分析中，研究者還發(fā)現(xiàn)，T細胞的表位也多與突觸糖蛋白和核蛋白有關(guān)，在一種完全不同的方法中，研究人員利用表位預(yù)測算法來預(yù)測線性B細胞的表位，來自德克薩斯大學奧斯汀分校的研究人員最近研究確定了突觸糖蛋白的三維結(jié)構(gòu)，這就能能夠幫助本文研究人員在預(yù)測表位時將蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)考慮進去，同時這種方法也證實了他們之前所預(yù)測的兩個可能的表位區(qū)域。

為了證實基于SARS-CoV同源性所鑒定出的SARS-CoV-2 T細胞表位，研究人員比較了不同的抗原表位，利用相同的方法，研究者驗證了根據(jù)與SARS-CoV序列相似性所確定的17個SARS-CoV-2 T細胞表位中的12個；最后研究者Sette說道，實際上我們發(fā)現(xiàn)，很多B細胞和T細胞表位在SARS-CoV-2和SARS-CoV之間具有高度保守性，這或許就為開發(fā)新型疫苗奠定了基礎(chǔ)，靶向作用這些區(qū)域的疫苗策略或許能夠幫助機體產(chǎn)生特殊的免疫力，不僅能提供交叉感染的保護能力，還能有效抵御病毒未來的進化。