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研究人員用AI技術(shù)突破動(dòng)物個(gè)體的自動(dòng)識(shí)別難題

2020-08-05 11:19來源:生物谷


西北大學(xué)郭松濤教授長(zhǎng)期從事野生動(dòng)物保護(hù)和行為生態(tài)學(xué)研究,在前人研究的基礎(chǔ)上,經(jīng)過多年探索,團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了對(duì)野生金絲猴的近距離觀察和個(gè)體識(shí)別(圖1),從而揭開了野生金絲猴種群的“神秘的面紗”,也推動(dòng)了中國(guó)靈長(zhǎng)類行為生態(tài)學(xué)的快速發(fā)展。 然而,在野外研究中,如何能24小時(shí)準(zhǔn)確、快速和無損傷的對(duì)野生個(gè)體快速識(shí)別和記錄,一直是該研究團(tuán)隊(duì),同時(shí)也是全世界動(dòng)物學(xué)家面臨的技術(shù)難題,更是限制目前動(dòng)物行為學(xué)和保護(hù)研究發(fā)展的一個(gè)“卡脖子”問題。

郭松濤教授針對(duì)這一前沿問題,與計(jì)算機(jī)科學(xué)領(lǐng)域的專家深度交叉融合,組建動(dòng)物AI(Artificial Intelligence,即人工智能)攻關(guān)團(tuán)隊(duì)。與西北大學(xué)房鼎益、陳曉江教授團(tuán)隊(duì)和西安電子科技大學(xué)苗啟廣教授團(tuán)隊(duì)展開合作,進(jìn)行動(dòng)物AI研究,利用金絲猴圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行金絲猴個(gè)體身份快速準(zhǔn)確識(shí)別。該團(tuán)隊(duì)基于金絲猴研究團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期對(duì)該物種特征的研究結(jié)果,利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)原理,提出具有關(guān)注機(jī)制的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型(圖2),**開發(fā)出基于Tri-AI技術(shù)的動(dòng)物個(gè)體識(shí)別系統(tǒng)。Tri-AI系統(tǒng)顛覆了依靠動(dòng)物個(gè)體特征(斑紋、顏色、傷疤)或者人為標(biāo)記特征(如烙印、刺青、染色、環(huán)志、無線電項(xiàng)圈及遺傳標(biāo)記)的傳統(tǒng)方法,實(shí)現(xiàn)了對(duì)野生個(gè)體的準(zhǔn)確身份識(shí)別和連續(xù)跟蹤采樣的功能(圖3)。更重要的是,該系統(tǒng)為在“理想條件下”實(shí)現(xiàn)“無觀察者干擾效應(yīng)”的動(dòng)物學(xué)研究提供了可能。


Tri-AI系統(tǒng)不僅適用多個(gè)物種,還可實(shí)現(xiàn)對(duì)夜間數(shù)據(jù)分析(圖4)。目前該系統(tǒng)已經(jīng)在靈長(zhǎng)類的41個(gè)代表性物種和4種食肉動(dòng)物群體進(jìn)行了適用性驗(yàn)證,平均識(shí)別精度達(dá)94.1%。該技術(shù)可每秒識(shí)別31張圖片,極大的提高了個(gè)體數(shù)據(jù)分析效率,未來可作為大數(shù)據(jù)分析的核心組件,為動(dòng)物學(xué)研究提供新的技術(shù)方案,也為實(shí)現(xiàn)野生動(dòng)物保護(hù)和智能管理提供可靠的技術(shù)支撐。


該研究成果以“Automatic identification of individual primates with deep learning techniques”為題(圖4),發(fā)表于CELL旗下綜合性子刊《交叉科學(xué)》(iScience)。西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院郭松濤教授是論文通訊作者和**作者,信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院許鵬飛副教授和西安電子科技大學(xué)苗啟廣教授為該論文的共同**作者。該技術(shù)已獲得3項(xiàng)國(guó)家發(fā)明**保護(hù)。該工作還受到國(guó)家自然科學(xué)基金委、中國(guó)環(huán)境科學(xué)研究院、中國(guó)科學(xué)院西安分院、陜西省科技廳、陜西省林業(yè)草地局、深圳野生動(dòng)物園,陜西省林業(yè)科學(xué)院,秦嶺大熊貓研究中心等單位的大力支持。