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單細(xì)胞測序預(yù)測化療的有效性

2020-08-27 14:47來源：生物谷


在最近一項(xiàng)研究中，來自密歇根大學(xué)的Jun Hee Lee博士課題組使用一種單細(xì)胞RNA測序的技術(shù)，**展示了單個癌細(xì)胞群中的各個細(xì)胞對化學(xué)療法引起的DNA損傷的基因表達(dá)差異。他們發(fā)現(xiàn)，這些反應(yīng)可以被分為三類：激控制細(xì)胞死亡，細(xì)胞分裂或應(yīng)激反應(yīng)。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在最近的《Cell Reports》雜志上。


“不同命運(yùn)的細(xì)胞實(shí)際上具有完全不同的基因激活圖譜，而這些不同的'轉(zhuǎn)錄組學(xué)格局'決定了化療對DNA造成損傷后細(xì)胞的命運(yùn)。”

該研究分析了來自三種結(jié)腸癌細(xì)胞系的10,000多個細(xì)胞。這些細(xì)胞首先接受化學(xué)藥物治氟尿嘧啶的處理，之后對其基因表達(dá)圖譜進(jìn)行了分別分析。“以前我們認(rèn)為，DNA損傷會導(dǎo)致相當(dāng)均勻的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，而我們的發(fā)現(xiàn)表明，不同的DNA損傷反應(yīng)基因伴隨著不同的細(xì)胞命運(yùn)走向。如果我們了解到某些亞群具有特定特征的細(xì)胞能夠在其他細(xì)胞死亡時存活下來，那么科學(xué)家們可能會尋找專門針對這些細(xì)胞的治療方法”。


由公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)副教授Hyun Min Kang博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組，也正在在線提供其數(shù)據(jù)供其他研究人員使用。“例如，其他科學(xué)家可以檢查化學(xué)療法治療前后在單個細(xì)胞中如何表達(dá)單個基因，以及特定基因的表達(dá)與化療劑量或其他基因的表達(dá)如何相關(guān)，研究人員還可以使用該在線工具測試新的假設(shè)并生成新的數(shù)據(jù)，因此有可能促進(jìn)對DNA損傷反應(yīng)的未來研究。”