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PCR Clean?助力分子生物學(xué),DNA修復(fù)與新型靶向性癌癥相關(guān)研究2023-09-04 14:16
PCR Clean?分子實驗是中常備的實驗試劑,可有效地降解大多數(shù)表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴(kuò)增子,質(zhì)粒或基因組DNA和RNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。 同源重組(HR)缺陷與DNA重排和細(xì)胞遺傳畸變有關(guān)。矛盾的是,與hr缺陷型癌癥相關(guān)的DNA重排類型對染色體結(jié)構(gòu)的影響微乎其微。 近日,為了解決這一明顯的矛盾,研究人員結(jié)合了46例BRCA1-或brca2突變型乳腺癌的數(shù)千個具有深連鎖閱讀WGS的腫瘤的短讀全基因組測序(WGS)圖譜的基因組圖譜分析。 相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為:“Long-molecule scars of backup DNA repair in BRCA1- and BRCA2-deficient cancers”。
這些數(shù)據(jù)揭示了一類獨特的富含hr缺陷的重排,稱為互易對。鏈讀WGS顯示,具有相同重排取向的互反對產(chǎn)生了兩種不同的染色體結(jié)果之一,只能通過長分子數(shù)據(jù)來區(qū)分。一個(順式)結(jié)果對應(yīng)于一個小片段的復(fù)制和粘貼到一個遙遠(yuǎn)的位點,第二個(反式)結(jié)果是一個準(zhǔn)平衡的易位或多兆堿基反轉(zhuǎn),在每個節(jié)點上都有大量(10 kb)的重復(fù)。我們提出了一個獨立于hr的復(fù)制-重啟修復(fù)機(jī)制來解釋互惠對結(jié)果的全部范圍。鏈接閱讀WGS還發(fā)現(xiàn)單鏈退火是人類癌癥中BRCA2缺乏特異性的修復(fù)途徑。將這些特征整合到分類器中可以提高BRCA1-和brca2缺陷基因組之間的區(qū)分。 總之,該研究的數(shù)據(jù)揭示了在hr缺陷細(xì)胞中,BRCA1或BRCA2缺乏癥特有的重排類型是細(xì)胞遺傳畸變的來源。 |