dPCR和qPCR之間的區(qū)別是什么？

dPCR（數(shù)字PCR）和qPCR（實(shí)時(shí)熒光定量PCR）是兩種在分子生物學(xué)研究中廣泛使用的核酸定量技術(shù)，它們之間存在一些顯著的區(qū)別。以下是對(duì)這兩種技術(shù)的詳細(xì)比較：

一、檢測(cè)原理

1. qPCR：

o 主要使用插入染料（如SYBR Green）或熒光探針（如TaqMan）來(lái)監(jiān)測(cè)整個(gè)擴(kuò)增過(guò)程。

o 隨著PCR循環(huán)的進(jìn)行，染料或探針的熒光強(qiáng)度逐漸增加，從而可以檢測(cè)到定量反應(yīng)的DNA。

o qPCR依賴于標(biāo)準(zhǔn)品制備的標(biāo)準(zhǔn)曲線來(lái)確定未知樣品的濃度，因此是一種相對(duì)定量的方法。

2. dPCR：

o 將一個(gè)樣本分成大量的微小反應(yīng)單元（通常是微滴或微孔），每個(gè)單元包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的核酸分子。

o 每個(gè)單元都進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)強(qiáng)度。

o 根據(jù)泊松分布原理以及陽(yáng)性反應(yīng)單元的比例，可以計(jì)算出起始模板DNA的濃度，因此dPCR是一種絕對(duì)定量的方法。

二、檢測(cè)流程

1. qPCR：

o 包括DNA提取、配置qPCR反應(yīng)體系、加入DNA模板、設(shè)置反應(yīng)條件及PCR擴(kuò)增、讀取結(jié)果等步驟。

o 通常需要使用標(biāo)準(zhǔn)品生成標(biāo)準(zhǔn)曲線，以進(jìn)行未知樣品的定量。

2. dPCR：

o 檢測(cè)流程與qPCR類似，但更強(qiáng)調(diào)樣本的精確分割和反應(yīng)單元的獨(dú)立性。

o 包括DNA提取、濃度檢測(cè)并稀釋、配置PCR反應(yīng)液、上機(jī)檢測(cè)、PCR擴(kuò)增和結(jié)果判讀等步驟。

o dPCR的結(jié)果判讀通常依賴于對(duì)每個(gè)微小反應(yīng)單元的熒光信號(hào)檢測(cè)，以及基于泊松分布的統(tǒng)計(jì)分析。

三、技術(shù)優(yōu)勢(shì)與特點(diǎn)

1. qPCR：

o 具有高度的敏感性和特異性，能夠?qū)崿F(xiàn)多重反應(yīng)和自動(dòng)化檢測(cè)。

o 實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)模式功能強(qiáng)大，具備定性、定量、突變檢測(cè)等多種功能。

o 技術(shù)成熟，有大量商業(yè)化產(chǎn)品可供選擇，且價(jià)格相對(duì)較低。

o 更適合高通量分析，動(dòng)態(tài)范圍寬。

2. dPCR：

o 準(zhǔn)確度與精密度高，較少受到擴(kuò)增效率的影響。

o 絕對(duì)定量，不需要標(biāo)準(zhǔn)品或標(biāo)準(zhǔn)曲線，直接計(jì)算樣品中目的核酸分子的個(gè)數(shù)。

o 抗干擾能力強(qiáng)，對(duì)抑制劑的抵抗能力高，適用于復(fù)雜樣本的檢測(cè)。

o 在微小差異面前表現(xiàn)優(yōu)秀，能夠鑒別差異小于20%的拷貝數(shù)。

四、應(yīng)用場(chǎng)景

1. qPCR：

o 廣泛應(yīng)用于病原體檢測(cè)、基因表達(dá)分析、遺傳病診斷等領(lǐng)域。

o 在高通量篩選和大規(guī)模實(shí)驗(yàn)中具有優(yōu)勢(shì)。

2. dPCR：

o 適用于需要高精度和高靈敏度的實(shí)驗(yàn)，如稀有突變檢測(cè)、基因拷貝數(shù)變異分析、無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)（NIPT）等。

o 在復(fù)雜樣本和抑制劑存在的情況下表現(xiàn)出色。

dPCR和qPCR在檢測(cè)原理、檢測(cè)流程、技術(shù)優(yōu)勢(shì)與應(yīng)用場(chǎng)景等方面存在顯著差異。研究人員應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求、樣本類型和實(shí)驗(yàn)條件等因素，選擇合適的技術(shù)進(jìn)行核酸定量研究。