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我國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤分子分型模型

2019-11-07 11:20來源：生物谷


近日，由北京協(xié)和醫(yī)院趙玉沛院士領(lǐng)銜，北京協(xié)和醫(yī)院吳文銘團隊與深圳華大生命科學(xué)研究院吳逵團隊合作在Gut雜志上發(fā)表了題為Whole-genome sequencing reveals distinct genetic bases for insulinomasand non-functional pancreatic neuroendocrine tumours： leading to a newclassification system的研究論文，探究胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤（PanNET）主要臨床分型的基因組水平差異。通過合作研究，利用多組學(xué)測序測序技術(shù)，系統(tǒng)比較了胰島素瘤和非功能性小胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤(NF-PanNET)基因組水平差異，基于基因組拷貝數(shù)變異（CNV）及單堿基突變，提出了分子分型模型，并揭示CNV對NF-PanNETs預(yù)后的預(yù)測價值。

   

研究團隊對比胰島素瘤及NF-PanNET基因組數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)胰島素瘤和NF-PanNET呈現(xiàn)出不同的突變特征。且在CNV層面上，胰島素瘤主要以拷貝數(shù)中性和拷貝數(shù)擴增為主；NF-PanNET主要以拷貝數(shù)中性、拷貝數(shù)擴增和拷貝數(shù)缺失為主；并以此提出5種亞型的分子分型。


通過比較分子分型模型中不同亞型預(yù)后，提示拷貝數(shù)擴增、拷貝數(shù)缺失的NF-PanNET復(fù)發(fā)風(fēng)險較高；同時，拷貝數(shù)擴增、拷貝數(shù)缺失的NF-PanNET中DAXX/ATRX基因突變比例較高，聯(lián)合拷貝數(shù)變化及DAXX/ATRX基因突變有助于更精準(zhǔn)的預(yù)測NF-PanNET的復(fù)發(fā)風(fēng)險和時機。


綜上，該研究對胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤不同臨床亞型的基因組變化進行了更深入研究，解釋了臨床分型與分子分型之間的關(guān)聯(lián)，提出了新的預(yù)后判斷指標(biāo)，為該疾病機制的研究、臨床的精準(zhǔn)治療提供了研究基礎(chǔ)。