文獻(xiàn)速讀——近期《Nature》大盤點(diǎn)

Nature：ecDNA如何促使癌基因表達(dá)擴(kuò)增？

原文標(biāo)題：

ecDNAhubs drive cooperative intermolecular oncogene expression

主流觀點(diǎn)一致認(rèn)為：基因都是在染色體上。而染色體外DNA（ecDNA）這一概念的出現(xiàn)顛覆了大家的傳統(tǒng)認(rèn)知。

ecDNA是一種存在于染色體外，高度開放的DNA 顆粒，普遍存在于人類癌細(xì)胞中。可以通過基因擴(kuò)增和改變基因調(diào)控來(lái)介導(dǎo)癌基因的高表達(dá)，被認(rèn)為與腫瘤的異質(zhì)性和耐藥性相關(guān)。

今日斯坦福研究人員，通過對(duì)致癌ecDNA的細(xì)胞核空間、表觀遺傳因子和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究發(fā)現(xiàn)：聚集在間期細(xì)胞核中的ecDNA可以“團(tuán)結(jié)協(xié)作”（強(qiáng)烈聚集），驅(qū)動(dòng)分子間增強(qiáng)子信號(hào)來(lái)促使癌基因表達(dá)擴(kuò)增。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34819668/

Nature：自身免疫干細(xì)胞樣CD8 T細(xì)胞群驅(qū)動(dòng)1型糖尿病

原文標(biāo)題：

An autoimmune stem-like CD8 T cell population drives type 1 diabetes

I型糖尿病屬于自身免疫疾病，仿佛是癌癥的對(duì)立面，為何免疫系統(tǒng)會(huì)有這兩種極端表現(xiàn)？

經(jīng)過四年的研究，研究人員給出了解答：自身反應(yīng)性T細(xì)胞繼續(xù)戰(zhàn)斗的能力取決于一群干細(xì)胞樣T細(xì)胞（stem-like T cell），后者會(huì)持續(xù)補(bǔ)充自身反應(yīng)性T細(xì)胞的庫(kù)存。

這種類型的干細(xì)胞樣T細(xì)胞以前從未在自身免疫性疾病中觀察過，他們認(rèn)為它可能對(duì)改善自身免疫性疾病和癌癥的治療有著重要的意義。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34847567/

Ausbian進(jìn)口血清

細(xì)胞工作好伙伴！

威正翔禹，，，Ausbian進(jìn)口特級(jí)胎牛血清小程序

Nature：揭示了癢覺感知的分子機(jī)制

原文標(biāo)題：

Structure，function and pharmacology of human itch receptor complexes

有研究人員發(fā)現(xiàn)，在背根神經(jīng)節(jié)中有一種特殊的感受器，可以感知氯喹及腦啡肽原降解產(chǎn)物（BAM8-22）引起的瘙癢信號(hào)，但這些信號(hào)不能引起疼痛，自此，癢覺受體家族逐漸被人們熟知。

近日，中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)就癢覺受體MRGPRX2對(duì)多肽和過敏性藥物的感知藥理學(xué)問題，進(jìn)行了詳細(xì)的表征。利用單顆粒冷凍電鏡技術(shù)解析了不同配體作用下癢覺受體MRGPRX2與Gi蛋白三聚體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。

研究人員發(fā)現(xiàn)癢覺受體有非常獨(dú)特的配體識(shí)別口袋；并結(jié)合生化和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)揭示了癢覺受體識(shí)別不同配體的通用機(jī)制，發(fā)現(xiàn)了癢覺受體特有的激活方式，并為靶向癢覺受體的藥物開發(fā)提供理論及結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34789875/

Nature：FABP4和核苷激酶的激素復(fù)合物調(diào)控胰島功能

原文標(biāo)題：

A hormone complex of FABP4 and nucleoside kinases regulates islet function

脂肪細(xì)胞中釋放能量?jī)?chǔ)存對(duì)于在能量不足時(shí)維持生存至關(guān)重要。然而，與胰島素抵抗和/或胰島素不足相關(guān)的，不受控制或慢性脂肪分解會(huì)破壞代謝穩(wěn)態(tài)。fabkin是一種最近發(fā)現(xiàn)的激素，它由多種蛋白復(fù)合而成，包括脂肪酸結(jié)合蛋白4 (FABP4)。盡管在臨床前模型和人體內(nèi)循環(huán)FABP4水平與心臟代謝疾病密切相關(guān)，但尚未描述其作用機(jī)制。

近日，有科研團(tuán)隊(duì)通過一系列實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)FABP4-ADK-NDPK復(fù)合物Fabkin代表了一種以前未知的激素和作用機(jī)制，它將能量狀態(tài)與代謝器官的功能相結(jié)合，是對(duì)抗代謝疾病的一個(gè)很有前途的靶點(diǎn)。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34880500/

德國(guó)MB qPCR支原體檢測(cè)試劑盒

支原體檢測(cè)行家！

威正翔禹，，，Minerva Biolabs 支原體檢測(cè)試劑盒小程序

Nature：藥物對(duì)腸道微生物組的影響巨大

原文標(biāo)題：

Combinatorial, additive and dose-dependent drug–microbiome associations

用藥情況在全球范圍內(nèi)越來(lái)越普遍。II型糖尿病、肥胖和冠狀動(dòng)脈疾病等心臟代謝性疾病的發(fā)病率與死亡率持續(xù)上升。受影響的人不得不持續(xù)服用多種藥物。

近日，德國(guó)科學(xué)家分析了28種不同藥物和幾種藥物組合的影響。

我們都知道，腸道微生物組由數(shù)十億個(gè)對(duì)身體正常功能至關(guān)重要的微生物組成。研究發(fā)現(xiàn)許多藥物對(duì)腸道細(xì)菌的組成和狀態(tài)有負(fù)面影響。

不僅如此，這些影響，比疾病、飲食和吸煙的影響加起來(lái)還要明顯。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34880489/

Nature：基因組相同的癌細(xì)胞，行為或許會(huì)不同！

原文標(biāo)題：

Non-genetic determinants of malignant clonal fitness at single-cell resolution

所有癌癥都是經(jīng)過一段克隆選擇期和克隆擴(kuò)增期后出現(xiàn)的。盡管越來(lái)越多關(guān)于腫瘤內(nèi)遺傳異質(zhì)性所賦予的進(jìn)化研究被發(fā)表，但對(duì)于導(dǎo)致腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和惡性克隆適應(yīng)度的非遺傳機(jī)制知之甚少。

最近，澳大利亞的科研團(tuán)隊(duì)，開發(fā)出一種可以幫助追蹤，隨時(shí)間延續(xù)，單一癌細(xì)胞的調(diào)節(jié)性基因組發(fā)生的變化的技術(shù)——單細(xì)胞分析和譜系追蹤(SPLINTR)。

通過這項(xiàng)技術(shù)，研究人員發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)惡性克隆優(yōu)勢(shì)是一種細(xì)胞固有的和可遺傳的特性，它通過抗原呈遞的抑制和分泌性白細(xì)胞肽酶抑制劑基因(Slpi)表達(dá)的增加而促進(jìn)，我們從遺傳學(xué)上驗(yàn)證了該基因是急性髓系白血病的調(diào)節(jié)劑。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34880496/

Nature：抗原呈遞的先天淋巴樣細(xì)胞調(diào)控神經(jīng)炎癥

原文標(biāo)題：

Antigen-presenting innate lymphoid cells orchestrate neuroinflammation

多發(fā)性硬化癥影響著全世界200多萬(wàn)人。包括阿爾茨海默病和帕金森病在內(nèi)的，其他慢性腦部炎癥疾病，也困擾著數(shù)以千萬(wàn)計(jì)的人。

有證據(jù)顯示，中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)中的促炎T細(xì)胞與多發(fā)性脫髓鞘和神經(jīng)退行性疾病有因果關(guān)系，但控制這些反應(yīng)的途徑尚不清楚。

在一項(xiàng)新的研究中，研究人員探究了一種稱為3型先天淋巴細(xì)胞（group 3 innate lymphoid cell, ILC3）的免疫細(xì)胞，并利用多發(fā)性硬化癥的小鼠模型證實(shí)大腦中的這些炎癥性ILC3作為抗原呈遞細(xì)胞發(fā)揮作用。

通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)：這些免疫細(xì)胞向T細(xì)胞展示髓鞘蛋白（包圍著神經(jīng)纖維的絕緣層的主要成分）片段，促使它們攻擊髓鞘，造成神經(jīng)損傷，從而引起疾病癥狀。他們發(fā)現(xiàn)炎癥性ILC3與小鼠大腦中的活躍炎癥和神經(jīng)損傷區(qū)域中的T細(xì)胞密切相關(guān)。

如果從ILC3中移除一種名為MHCII的關(guān)鍵分子，則可以阻止這些小鼠患上類似于多發(fā)性硬化癥的疾病。其中MHCII通常用于抗原呈遞過程。這種移除基本上可以阻止這些免疫細(xì)胞激活攻擊髓鞘的T細(xì)胞的能力。

該研究的數(shù)據(jù)定義了炎癥性ILC3群體，這對(duì)直接促進(jìn)中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的t細(xì)胞依賴性神經(jīng)炎癥至關(guān)重要，并揭示了利用周圍組織中的ILC3預(yù)防自身免疫性疾病的潛力。

原文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34853467/